Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms