Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 AC055811.3-201ENST00000584952 686 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN23Q96B33 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms