Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LMO3Q8TAP4 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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