Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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C9orf40Q8IXQ3 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
C9orf40Q8IXQ3 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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