Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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ATG4DQ86TL0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ATG4DQ86TL0 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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