Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
TRAPPC6BQ86SZ2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
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