Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
BHLHA9Q7RTU4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
BHLHA9Q7RTU4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms