Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR0

NLRP9, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP9Q7RTR0 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
NLRP9Q7RTR0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
NLRP9Q7RTR0 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms