Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 SLC25A15P1-201ENST00000456738 342 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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USP34Q70CQ2 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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USP34Q70CQ2 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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USP34Q70CQ2 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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USP34Q70CQ2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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USP34Q70CQ2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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USP34Q70CQ2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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USP34Q70CQ2 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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USP34Q70CQ2 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 RFPL3-201ENST00000249007 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
USP34Q70CQ2 ZNF671-203ENST00000596939 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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