Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
BRMS1LQ5PSV4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
BRMS1LQ5PSV4 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms