Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ODF2Q5BJF6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.7 ms