Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FXNQ16595 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FXNQ16595 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FXNQ16595 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FXNQ16595 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
FXNQ16595 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
FXNQ16595 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
FXNQ16595 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FXNQ16595 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FXNQ16595 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms