Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
GRIK5Q16478 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GRIK5Q16478 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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