Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NTRK3Q16288 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms