Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CNGA3Q16281 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms