Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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SCN9AQ15858 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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SCN9AQ15858 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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SCN9AQ15858 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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SCN9AQ15858 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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SCN9AQ15858 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SCN9AQ15858 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SCN9AQ15858 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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