Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 HPS3-201ENST00000296051 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NEDD8Q15843 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NEDD8Q15843 TBR1-201ENST00000389554 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NEDD8Q15843 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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NEDD8Q15843 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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NEDD8Q15843 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
NEDD8Q15843 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NEDD8Q15843 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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