Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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CYTH1Q15438 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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CYTH1Q15438 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CYTH1Q15438 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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