Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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NFIXQ14938 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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NFIXQ14938 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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NFIXQ14938 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NFIXQ14938 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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NFIXQ14938 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NFIXQ14938 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
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