Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 C7orf65-201ENST00000408988 2911 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CCNIQ14094 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms