Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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