Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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TOP3AQ13472 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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TOP3AQ13472 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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TOP3AQ13472 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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TOP3AQ13472 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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TOP3AQ13472 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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TOP3AQ13472 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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TOP3AQ13472 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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TOP3AQ13472 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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TOP3AQ13472 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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TOP3AQ13472 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
TOP3AQ13472 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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TOP3AQ13472 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
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TOP3AQ13472 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
TOP3AQ13472 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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