Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 RN7SL371P-201ENST00000578099 267 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTK7Q13308 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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