Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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CHAF1BQ13112 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
CHAF1BQ13112 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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