Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
FOXD4Q12950 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
FOXD4Q12950 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms