Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CDH17Q12864 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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