Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
STX4Q12846 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
STX4Q12846 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms