Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TROQ12816 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TROQ12816 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TROQ12816 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TROQ12816 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TROQ12816 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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