Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
FOXO1Q12778 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms