Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
APOBRQ0VD83 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms