Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NIPAL4Q0D2K0 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NIPAL4Q0D2K0 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms