Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FPGSQ05932 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms