Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NUCB1Q02818 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms