Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CYP27A1Q02318 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms