Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AL512324.3-201ENST00000619383 882 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 Z82185.1-201ENST00000417792 549 ntTSL 4 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CENPEQ02224 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms