Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HTRA4P83105 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HTRA4P83105 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms