Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CTRLP40313 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CTRLP40313 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CTRLP40313 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CTRLP40313 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CTRLP40313 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CTRLP40313 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 PNKD-203ENST00000273077 3021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 ENG-202ENST00000373203 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CTRLP40313 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CTRLP40313 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms