Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZEB1P37275 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms