Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DDIT3P35638 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.3 ms