Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NTF4P34130 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NTF4P34130 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NTF4P34130 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms