Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXC13P31276 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXC13P31276 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms