Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
TSPOP30536 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
TSPOP30536 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TSPOP30536 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TSPOP30536 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TSPOP30536 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
TSPOP30536 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PRPF38A-201ENST00000257181 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
TSPOP30536 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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