Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GJB2P29033 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GJB2P29033 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GJB2P29033 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms