Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 GMEB2-203ENST00000370077 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 SLC24A4-204ENST00000531433 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
PLNP26678 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 PRR26-201ENST00000381489 7250 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
PLNP26678 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms