Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PTPREP23469 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPREP23469 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPREP23469 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPREP23469 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PTPREP23469 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPREP23469 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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