Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FGFR4P22455 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms