Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDSP20132 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SDSP20132 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDSP20132 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDSP20132 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SDSP20132 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDSP20132 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDSP20132 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDSP20132 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDSP20132 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SDSP20132 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SDSP20132 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SDSP20132 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDSP20132 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDSP20132 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SDSP20132 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.8 ms