Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRIM21P19474 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TRIM21P19474 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms