Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CEP250-201ENST00000397524 1419 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ATF3P18847 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC122719.1-201ENST00000507989 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ATF3P18847 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ATF3P18847 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms