Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EPB42P16452 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
EPB42P16452 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
EPB42P16452 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPB42P16452 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPB42P16452 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPB42P16452 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
EPB42P16452 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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